1　噪聲問題在風機盤管體系中，有時一開機會產生令人煩躁的噪聲，從而使整個體系的運行狀況極不正常。造成這種現象的原因通常是因為風機盤管電機長時間運轉電機軸承磨損，安裝時不牢固，風機產生的噪聲。處理的方法更換電機軸承和加固。

2　回風過濾問題許多選用風機盤管體系的房間，在first～2年空調作用很好，3年以后冷量下降很多，室溫無法降下來。經調查，原因是回風口未裝空氣過濾網。因為風機盤管體系為濕工況運行，若回風未過濾，空氣中含塵量較高，空氣中的塵埃或其它細微纖維，遇上濕潤的盤管會沾在上面，很難清理，久而久之，導致盤管熱交換功率下降，使室溫無法達到下降溫度要求。所以但凡臥式暗裝風機盤管，在條件下應加裝空氣過濾器網。